1000 jaar geleden stuurde Keizer Geardo van het Naga Emperium een leger aan machine soldaten om het Sky Kingdom van Garuda te belegeren. Dankzij de inzet van Princess Cecilia en Rodea, een machine soldaat die belooft heeft Garuda te beschermen, word de invasie afgeweerd.

In de huidige tijd ontdekt een ijverige uitvinder, Ion, een achtergelaten robot te midden van een bloedhete woestijn. Na het uitvoeren van alle reparaties komt de robot weer tot leven, dit blijkt niemand minder dan Rodea zelf te zijn! Rodea leert dat het Naga Emperium niet meer bestaat en dat Garuda al 1000 jaar vrede kent.

Deze vrede zal echter niet lang meer duren, want het Naga Emperium lijkt wedergekeert. Rodea herinnert zich zijn belofte van 1000 jaar geleden en gaat wederom de strijd aan tegen de macht van het Naga Emperium.