In Teenage Zombies wordt de Aarde aangevallen door een horde buitenaardse "Brain Thingys". De mensheid is onderworpen aan hun superieure wapens en technologie en slaagt er niet in om Aarde de beschermen van The Big Brain en zijn leger. De enige hoop ligt in de handen van drie Teenage Zombies die uit hun graf zijn opgestaan nadat hun rust verstoord werd door de invasie.

Het ondode trio negeert hun normale menselijke slachtoffers en richt zich op de pulserende roze hersenen die ze overal zien, met The Big Brain als feestmaal. The Big Brain komt er snel achter dat hij dit ‘superras’ over het hoofd heeft gezien en richt zich volledig op het trio.