De favoriete vakantie van Scooby-Doo en Shaggy staat voor de deur! Met nepmonsters en snoep in overvloed - Halloween is de hemel voor deze hongerige fijnproevers die van deur tot deur gaan. Maar dit jaar wordt hun zoete vakantie zuur als de pompoenplek in de buurt is geïnfecteerd door giftige modder, waardoor hoogvliegende jack-o-lantaarns ontstaan en een levensgrote pompoenleider alles op zijn pad verplettert. Het is aan Scooby-Doo en de bende terwijl ze samenwerken met hun vrienden, Bill Nye The Science Guy en Elvira Mistress of the Dark, om dit mysterie van gigantische proporties op te lossen en Crystal Cove te redden!