Willy, een orka van meer dan drie ton, en zijn boezemvriend Jesse beleven nieuwe avonturen in dit nog spannender vervolg op de hartverwarmende familiefilm uit 1993. Jesse is intussen al een paar jaartjes ouder en meisjes laten hem niet langer koud.Verder trapt hij lol met zijn onstuitbare jongere halfbroertje Elvis en heeft hij het best naar zijn zin bij zijn pleegouders. Een weerzien met Willy zit er helaas niet meer in, denkt hij.Maar tijdens een vakantie in de Pacific Northwest leert hij niet alleen een leuk meisje kennen, hij ziet er ook Willy en zijn familie terug! Wanneer een tanker echter aan de grond loopt en olie begint te verliezen, zitten de orka's in de val. Tot overmaat van ramp vat de olievlek ook nog vuur en moet Jesse een vlammenzee trotseren om Willy en zijn gezin te redden...en hopen dat Willy hem eveneens uit de penarie zal helpen.